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植物dna提取后怎么保存(植物DNA提取的方法)

时间:2024-01-31 13:50:57
分子(DNA、RNA)样品的保存

本文将介绍DNA、RNA的保存策略,顺带提及细胞的保存方法。

DNA为双螺旋结构,具有较高稳定性,但在野外样品采集的过程中仍需注意,以防降解。下面介绍以测序为目的的 植物DNA 采集与保存方法。

(一)组织的采集

通常 采集 用于测序的材料为当年生新鲜、幼嫩(近成熟)的健康组织,多以叶片为主,但当叶片难以获得时亦可采集植物的其它组织或器官(如芽、花、果实和种子等)。每份样品采集3-5g(鲜重),若为叶片可以表面积不小于50cm 2 计算(尺寸大小约等于成年人的手掌面积),每号DNA材料很好分为2份保存。可以将新鲜的植物DNA材料快速放入液氮(或带有冷藏功能的采集箱)中直至运输回实验室 [1] ,回实验室后存于液氮或改用-80℃超低温保存,无需干燥,可长期保存(2年需行检查)。

用液氮或采集箱保存的 缺点 是不利于野外作业,下面着重介绍 干燥保存 的方法 [2] 。将新鲜的植物DNA材料置于柔软且透气性较好的纸袋中进行干燥。透气的纸袋可以将植物DNA材料在干燥时与 硅胶(干燥剂) 分开,这样即便植物叶片因干燥变脆后,也不会在运输过程中被硅胶挤碎,不会与硅胶混杂,并造成样品间的交叉污染。如果没有类似的纸袋也可用塑料的自封袋替代,但植物DNA材料就需要与硅胶置于一起进行干燥。

对于易失水的植物DNA材料(如纸质叶或幼嫩叶片等),应在野外采集DNA材料并立即进行快速干燥;对于不易失水的植物遗传物质材料(如革质叶或蜡质叶等),可在采集后放置一段时间( 在叶片失水前 ),然后再进行干燥,但很好在采集后立刻干燥;对于难于用硅胶快速干燥的遗传物质材料(如较厚或具多浆的叶片或种子等),可将这些材料碎成小片(块)后用硅胶快速干燥。

目前快速干燥植物DNA材料的很佳方式是硅胶(一种干燥剂),能够使植物材料在短时间内快速脱水,并且对DNA的损伤较小。有粉末状的白色硅胶(直径为20~30 Å)与变色硅胶(蓝色)两种类型可供选用,但混合使用效果更佳。粉末状硅胶能与组织紧密接触,加快干燥效率,变色硅胶则能显示出干燥的情况。通常变色硅胶是必要的,而粉末状硅胶可酌情使用。使用时应放入足够的硅胶( 使硅胶覆盖全部的遗传物质材料 )进行快速干燥。

(二)组织的保存

利用硅胶对植物组织干燥处理之中或之后,除野外采集过程,均需置于合适的环境当中。该环境的条件为温度(4-15℃)、湿度(相对湿度小于10%-30%),如果没有相应的保存条件,可在室温下保存,但一定保持在通风条件良好且干燥的环境下;植物DNA材料也可以在低温(-20℃)或超低温(-80℃)条件下保存,但需要保持DNA材料的干燥状态。尽管在这些条件下看似保险,但实际上植物DNA材料(如叶片等)很难长期保存,如在室温下保存超过2年的植物DNA材料其基因组DNA就会发生降解。因此另一种策略是保存总DNA。

(三)总DNA的保存

利用常规的方法(CTAB法、SDS法、试剂盒法等)提取材料总DNA,保存前需检查DNA的完整性、纯度、浓度和含量等。

植物总DNA的保存很好以 干粉状态 保存,如果总DNA以 溶液 形式保存,则用1 × TE缓冲液稀释,且TE的缓冲液的pH值为8.0-8.5之间。植物总DNA低温保存很好在-80℃以下或液氮保存,无条件的也可在-20℃保存;总DNA应避免经常冻融;同时建议每份样品保存3-5个样本。总DNA提取后保存的时限通常较组织要长(>两年),但若长期保存,每隔两年应抽测,对不符合使用要求的DNA进行更新。

RNA为单链分子,稳定性差,极易降解,降解的主要原因是内源性核酸酶(ribonuclease,RNAase)的作用,它在活体内的存在时间也不长。然而外源性RNA酶也不容忽略,头发、灰尘、体液、塑料等均有RNA酶的存在。因此RNA的保存需极其谨慎,提取时应该戴帽子、口罩、橡胶无菌手套,并在洁净、灰尘少的地方提取。从组织材料的采集开始,经运输与储存,包括实验的全过程,涉及到RNA的均需将其处于 液氮 中 [3] ,该温度下细胞生理生化过程近乎停止,方能较长时间保存。这意味着不仅组织材料需保存于液氮中,实验操作也需保证液氮充足供应。将样品保存于-80℃等均无法制止RNA的局部或完全降解。

细胞是DNA、RNA的载体,细胞也构成了组织。当涉及专属的细胞学实验时,便需要特殊的方法对其保存,这往往是细胞工程的基础。例如做单细胞克隆,要求细胞具有活力。又如基于某些目的使用流式细胞术分析细胞,此时要确保细胞能够相互分离,通常要求细胞具有活性,糖在细胞内的累积会导致分析不准。液氮的低温环境(-196℃)是目前很佳的冷冻保存温度,复苏后细胞的结构和功能完好。如果冷冻过程得当,一般生物样品在-196℃下可保存十年以上。应用-80℃保存细胞,短期内对细胞的活性无明显影响,但随着冻存时间延长,细胞存活率明显降低。

不同层次的样品,需根据样品性质、实验目的、保存条件,综合分析,选择很适合的方法。目的样品是分子水平,就需从分子角度考虑组织的保存;细胞水平,则是从细胞角度考虑。不同层次对细胞的活性要求也不同。

[1] 王珍,方宣钧.植物DNA分离[J].分子植物育种,2003(02):281-288.

[2] 高连明,刘杰,蔡杰,等.关于植物DNA条形码研究技术规范[J].植物分类与资源学报,2012,34(06):592-606.

[3] 张荻.百子莲花芽分化及开花机理研究[D].东北林业大学, 2011.

[1] RNA降解原理 . Cas9X海星生物 - 搜狐.

[2] 【科学普及】“很好细胞”的保存——浅谈细胞冻存 . 政务:细胞世界 - 澎湃.

请教植物DNA提取

专用简单方法:1、将小指甲大小叶片用液氮快速磨碎。2、快速加入专用DNA提取液,用移液枪吸打几下后将液体吸入1.5MLEP管内。3、离心12000R,10min。4、将上清液吸入1.5MLEP管内,加入异丙醇,上下颠倒。5、离心12000R,10min。6、倒掉上清液,干燥DNA。7、将DNA溶于60uLDDH2O -20℃保存。

优点:快速、方便、无毒。

博凌科为的快速植物DNA提取扩增套装容易储存吗,有什么限制吗?

这款产品还是比较容易储存的。

产品储存:

Buffer A 和Buffer B室温保存12个月,注意温度低时Buffer A或者Buffer B可能有沉淀析出,应该在37℃水浴重新溶解澄清后使用。其它成分-20 ℃保存。

产品介绍:

本试剂盒包含了快速制备基因组DNA和PCR扩增的所有试剂,适用于从植物组织一步法提取基因组DNA并用于PCR扩增。整个提取过程无需蛋白酶K消化和有机溶剂抽提,无需无水乙醇沉淀,简便、快捷,而且质量稳定可靠。本试剂盒提供的2x PCR Reagent 是一种扩增兼容性很强的PCR 试剂,无需彻底去除蛋白等杂质,便能进行高效特异扩增,特别适合于高通量的筛选。

CTAB法提植物组DNA时,65℃水浴后为什么室温放置30min

植物基因组提取时为什么要65度水浴保温

植物DNA提取方法

方法一:

取两片幼嫩新鲜叶片,置于预冷的研钵中,倒入适量液氮,迅速研磨成粉末状,随后加入3ml预热的2%CTAB抽提缓冲液和50ul抗氧化剂2-巯基乙醇,继续研磨成略有流动性的糊状或粥状,转入1.5ml的离心管中,于65℃水浴锅中保温约60min。

2.待混合物冷却至室温后加入等600ul的CI(氯仿:异戊醇=24:1)溶液混匀,轻轻颠倒离心管几次使管内混合物成乳浊液,常温下10000rpm离心10min,取上清液转入另一干净的离心管中。

3.重复步骤(2)一次。

4.取步骤(3)上清液加入2.5倍体积无水乙醇,仔细混匀,-20冰箱30min以上,沉淀DNA  4℃,12000rpm离心10min。

5.弃去上层有机溶剂,加500ul75%乙醇洗涤沉淀,4℃下8000rpm离心5min,弃去上清,洗涤沉淀3次。

6.倒置或者37度培养箱烘干。

7.加50ulTE缓冲液溶解DNA,于-20℃冷藏备用。

方法二:

在50ml离心管中加入20ml提取缓冲液Ⅰ, 60℃水浴预热。

2. 植物5-10g, 剪碎, 在研钵中加液氮磨成粉状后立即倒入预热的离心管中, 剧烈摇动混匀, 60℃水浴保温30-60分钟(时间长,DNA产量高), 不时摇动。

3. 加入20ml氯仿/戊醇/乙醇溶液, 颠倒混匀(需带手套, 防止损伤皮肤),室温下静置5-10分钟, 使水相和有机相分层(必要时可重新混匀)。

4. 室温下5000rpm离心5分钟。

5. 仔细移取上清液至另一50ml离心管,加入1倍体积异丙醇,混匀,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。

6. 在1.5mleppendorf中加入1ml TE。用钩状玻璃棒捞出DNA絮团,在干净吸水纸上吸干,转入含TE的离心管中,DNA很快溶解于TE。

7. 如DNA不形成絮状沉淀,则可用5000rpm离心5分钟, 再将沉淀移入TE管中。这样收集的沉淀,往往难溶解于TE,可在60℃水浴放置15分钟以上,以帮助溶解。

8. 将DNA溶液3000rpm离心5分钟,上清液倒入干净的5ml离心管。

9. 加入5μlRNaseA(10μg/μl), 37℃ 10分钟, 除去RNA(RNA对DNA的操作、分析一般无影响,可省略该步骤)。

10. 加入1/10体积的3mol/L NaAc及2×体积的冰乙醇,混匀,-20℃放置20分钟左右,DNA形成絮状沉淀。

11. 用玻棒捞出DNA沉淀,70%乙醇漂洗,再在干净吸水纸上吸干。

12. 将DNA重溶解于1ml TE, -20贮存。

13. 取2μlDNA样品在0.7% Agarose胶上电泳, 检测DNA的分子大小。同时取15μl稀释20倍, 测定OD260/OD280, 检测DNA含量及质量。

植物DNA提取后怎么保存

短时间的话,将提取到的DNA溶于无菌水或TE缓冲液,放于4℃冰箱保存即可。

CTAB法提取植物DNA

(1)可以的,液氮冷冻更容易破碎细胞壁释放DNA,但是不冷冻也没关系的,提取的DNA量即使少点也足够满足试验要求。

(2)-20度足够保存,用一年以上都没问题,超低温保存时间当然更长,但是切忌反复冻融,建议提取后直接分装,以后使用每次取一管

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